酸洗磷化废水处理首先要解决的便是废水中的酸带来的问题，常用的是利用加药系统加入碱性物质如生石灰、氢氧化钠等进行酸碱中和反应，调节废水pH值后加入适当的混凝剂使废水中的磷酸盐、金属离子生成不溶性磷酸盐与难溶于水的金属氢氧化物等沉淀物，随后将沉淀经过斜管、竖流等方式沉淀池排入污泥池中，上清液再经过一次pH调整后排入砂滤池过滤，最后达标排放或回用。
一般酸洗磷化废水的水量较小，处理难度不算高，企业可以根据自身规模与废水量选择建设废水处理系统或是与有资质的危废处置公司合作，废水量较大的可以选择根据实际所需建设一套废水处理系统，或是安装一体化废水处理设备。
